丹東市疾病預防控制中心成立于2003年6月23日。它是丹東市人民政府根據國務院、遼寧省人民政府有關衛生監督和疾病預防控制體制改革的總體要求，將原丹東市衛生防疫站、丹東市勞動衛生監督監測管理所、丹東市地方病防治研究所、丹東市鼠防中心和丹東市性病防治所等單位的疾病預防控制、健康危害因素監測與評價、衛生學檢測預防性健康體檢、免疫接種、預防醫學臨床研究等相關職能合并組建的，集“防、治、教、研、管”五位一體的地市級疾病預防控制專門機構，直屬丹東市衛生局。